距离第一季结尾已过去两年。泰勒和海莉在荒野中艰难求生，背后一直遭到一台失控的“狂怒”机甲追杀。他们发现这台机甲里驾驶舱锁着一个前怪兽教官——博士艾伦，他声称自己能“听懂”怪兽的集体意识。艾伦带他们回到已变成废墟的黑色禁区，指出真正的威胁从来不是地面的先锋级怪兽，而是地下千米处一只正在孵化、体型堪比整座悉尼的“母皇”。更恐怖的是，艾伦脑中被植入的芯片显示，母皇的基因里混杂着人类DNA——这是某次失败的人兽融合实验的产物。兄妹二人必须用一堆破铜烂铁，赶在母皇破土前，给它戴上枷锁。

第二季全面升级，从地面肉搏转向地下探险，氛围压迫感极强。新角色艾伦的加入带来了大量伦理困境，人与怪兽的界限被彻底模糊。最终决战机甲与怪兽的融合形态设计堪称天才，完美延续了环太平洋系列的废土美学。